Чтобы зашифровать диск, на который установлена Windows, компьютер создаст два раздела: системный раздел (который содержит файлы, необходимые для запуска компьютера) и раздел операционной системы (на котором находится Windows). Раздел операционной системы будет зашифрован, а системный раздел останется незашифрованным, следовательно компьютер можно будет запускать.
В версиях старше Windows 7 можно создать эти разделы вручную. В Windows 7 / 8 разделы создаются автоматически. Если на компьютере нет системного раздела, мастер BitLocker создаст его, использовав 200 МБ доступного дискового пространства. Системному разделу не присваиваться буква диска и он не будет отображаться в папке «Компьютер».